谷歌DeepMind发布AlphaGenome 2,可预测DNA变化对特定细胞类型的影响

该模型基于68种组织的1亿多个单细胞图谱训练,识别出的改变基因表达的变异数量接近前代模型的两倍,现已开放用于非商业研究。
为何重要
同一个基因变异在不同细胞类型和状态下的作用可能截然不同,这也是大多数与疾病相关的变异难以解读的原因。AlphaGenome 2从组织层面的预测细化到具体细胞类型和状态,DeepMind称它无需重新训练即可对新细胞类型作出预测,并能指出实验数据中的空白。它不会取代第一代AlphaGenome,因为更精细的预测需要更多算力。接下来值得关注独立验证、药企的采用情况,以及DeepMind提到的跨物种和虚拟细胞研究。
要点
- 基于1亿多个单细胞图谱训练
- 覆盖68种组织
- 识别的表达改变变异接近前代两倍
- 无需重新训练即可预测新细胞类型
- 开放用于非商业研究
- 去年发布的AlphaGenome的后继者