中国科大团队发表开源RNA基础模型structRFM,基于2100万条序列-结构配对训练

《自然》论文称,其三维结构版本Zfold在CASP15、CASP16和RNA-Puzzles上的表现与AlphaFold3相当;完整数据集、权重和代码均已开放。
为何重要
多数RNA语言模型只从序列学习,但RNA的功能取决于其折叠方式。structRFM把碱基配对纳入预训练,并用名为MUSES的多来源二级结构集合来减少单一预测工具带来的偏差。作者报告其在二级结构预测上创下新基准,并在功能预测任务上有所提升,包括新发布的RNA家族和长链非编码RNA。由于2100万对数据集和模型权重均已公开,其他团队可以直接检验与AlphaFold3的对比;接下来关注独立验证结果及其在RNA药物设计中的应用。
要点
- 2026年11月4日发表于《自然》
- 基于2100万条RNA序列-结构配对训练
- 采用多来源二级结构集合MUSES
- 三维版本Zfold在CASP15、CASP16和RNA-Puzzles上与AlphaFold3相当
- 数据集、模型权重和源代码全部开放
- 由中国科学技术大学开发